手动挡汽车的变速箱和自动挡在工作原理、特点及内部结构等方面存在明显区别。首先工作原理上，手动挡需要驾驶员手动拨动变速杆改变齿轮啮合位置来变速，而自动挡则能根据车速和发动机转速自动换挡。

从特点来看，手动挡具有机械结构简单、动力损耗小且省油耐用的特点，而自动挡则操作轻松、变速范围灵活。在内部结构方面，手动挡主要由齿轮和轴构成，而自动挡则包含液力变扭器等复杂部件。

从传输效率来看，手动挡变速箱有着先天优势。手动挡变速箱完全机械式，动力传递直接，几乎没有过多的能量损耗在中间环节，使得发动机输出的动力能高效地传递到车轮上。相比之下，自动挡变速箱，特别是常见的液力变矩器驱动的类型，在动力传输过程中，会因为液力传动的特性，存在一定的能量损失，导致其工作效率略逊一筹。

在油耗方面，同品牌同排量的车，手动挡比自动挡能节油10%左右，这对于长期用车来说，能节省一笔不小的开支。在换挡灵活性上，两者也大不相同。手动挡需要驾驶员根据路况、车速等因素，自行判断并手动操作换挡，对驾驶技术有一定要求。若换挡时机把握不好，可能影响驾驶体验和车辆性能。而自动挡则具备强大的自适应能力，可根据车辆行驶状态自动调整挡位，无论是在城市拥堵路段频繁启停，还是在高速行驶时，都能适时换挡，让驾驶变得更加轻松流畅，这也是很多新手和女性驾驶者偏爱自动挡的原因。

此外，自动变速器的种类更为丰富多样，包含自动变速器、无级变速自动变速器、手自一体变速器等多种类型，能满足不同消费者对驾驶体验和性能的需求。而手动挡变速箱相对单一，主要专注于传统的机械换挡模式。

手动挡和自动挡变速箱各有千秋。手动挡以其纯粹的机械感、高效的动力传输和较低的成本，为热爱驾驶操控的人带来乐趣；自动挡凭借便捷的操作、良好的适应性和多样的类型选择，成为追求轻松驾驶体验人群的首选。消费者可根据自身驾驶习惯、需求和喜好来做出合适的选择。